С 1936 по 1939 год Эфроимсон был сотрудником Среднеазиатского НИИ шелководства, с 1939 по 1941 году был сотрудником на Всеукраинской станции шелководства. В 1945 году он начал преподавать в Харьковском университете. Ну а в 1948 году он решил отдать весь свой научный труд в Отдел науки ЦК ВКП.

В 1949 году Эфроимсона снова арестовали, и освободили в 1956 году.

В 1956 году он устроился работать в качестве библиографа во Всесоюзной государственной библиотеке иностранной литературы в городе Москва.

С 1961 года он работал в Институте сывороток и вакцин Министерства здравоохранения, в 1968 году он в Московском институте психиатрий был заведующим отделением генетики, ну а в 1976 году в Институте биологии развития АН был заведующим консультантом. В основном его научные направления - это медицинская генетика. Эфроимсон смог объяснить принцип равновесия, которые имеется между мутационным отбором и процессом. В 1932 году ему удалось рассчитать частоту мутирования генов человека. Эфроимсон очень любил камины, и всю жизнь мечтал построить в своем загородном доме камин, но, увы, его мечта так и не осуществилась.